По данным Сумского облсовета, г-н Макаренко был известным ученым-энциклопедистом, археологом, историком искусства, художником. Он успешно окончил в Петербурге училище технического рисования и археологический институт. Был научным сотрудником Эрмитажа, тщательно исследовал его художественные сокровища. Работал в Украинской Академии искусств. В институте материальной культуры возглавлял секцию искусствоведения и археологии, был избран действительным членом Украинского археологического комитета. Возглавлял Киевский музей западного и восточного искусств, работал научным сотрудником Академии наук Украины. Ученый участвовал во многих научных экспедициях, сам провел немало важных археологических исследований. Обследовал и проводил раскопки древних памятников и в Роменском крае.
Участвовал в организации и пополнении ценными экспонатами музеев в Ромнах, Полтаве, Прилуках, Сумах, Донецке, Луганске, Мариуполе, Чернигове. В 1934 году Макаренко был единственным среди членов комиссии, кто отказался подписать документ о сносе Михайловского Златоверхого собора в Киеве. За это в 1937 году Николай Макаренко приговорен к расстрелу. Точное место захоронения его не установлено. В Киеве, на воротах Михайловского Злотоверхого собора, неприкосновенность которого так решительно защищал Макаренко, невинно замученному ученому установлена ​​мемориальная доска.