Если я ничего не путаю, то мы на фирме работаем в программе 1С:Бухгалтерия, там же есть и зарплатный раздел. Если хотите могу подробности расспросить завтра у наших сотрудников?

Извините, что влажу, узнайте пожалуйста, для меня эта тема тоже сейчас актуальна, пытаемся на фирме тоже наладить учет. И обязательно спросите какую версию используют. Заранее спасибо!

1С:Бухгалтерия- одна из самых популярных программ в наше время, но она не самая удобная, приходилось в ней работать. Разумнее всего Вам, автор, заказать разработку персонального программного обеспечения с учетом всех необходимых нюансов Вашей фирмы. Вы можете попробовать обратиться в эту компанию https://delta-soft.ua/. Мне кажется, что хотя бы можно послушать их предложение, возможно это то, что Вам нужно.